Avogadro adalah software kimia gratis, open source,
tersedia dalam berbagai paltform sistem operasi merupakan editor molekul yang
dirancang untuk digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan
molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro
yang tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode
sumber sumber tersedia di bawah GPL GNU.
Tampilan
yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat keras kebanyakan sekarang.Software ini
adalah hasil proyek komunitas dengan banyak kontributor, makanya disebut open
source, siapapun boleh memberikan umpan balik, melaporkan bug dan kode agar
menjadi lebih baik.
Karena
ukurannya yang sangat kecil dan tidak terlalu memerlukan hardware dengan spek
yang tinggi dan mahal maka sangat cocok digunakan saat pelajaran kimia pada
materi-materi tertentu, dapat digunakan secara langsung di kelas. Tentu kita
harus memahami berbagai seluk-beluknya. Ini adalah alternatif pembelajaran yang
mengajak siswa mengamati secara langsung proses dan sifat kimia suatu zat.
Nah sekarang saya akan memberikan informasi tentang
cara menggunakan aplikasi avogadro.
Pertama adalah buka aplikasi avogadro, maka akan
muncul tampilan seperti dibawah ini.
Jika Background hitam kurang menarik bagi Anda, Anda
bisa mengganti Background tersebut. Caranya adalah View menu → set background color. Pilih warna yang Anda kehendaki
Hasilnya
:
Untuk memulai membuat bentuk molekul, cara yang pertama adalah
klik tool settings. Maka akan muncul tampilna seperti di bawah ini.
Langkah selanjutnya adalah, pilih ball
and stick pada display types. Dan tentukan molekul apa akan Anda gambar.
Semisal saya inggin mencoba menggambar C3H8. Maka pada draw Settings, saya
memilih atom pusat C, kemudian bond Order adalah single(karena ikatan di C3H8
adalah tunggal), kemudian check pada adjust Hydrogens. Gambar molekul pada
lembar kerja.
Sudut yang terbentuk pada gambar diatas
belum tepat, maka untuk mengetahui sudut ikatan yang tepat adalah klik pada
“Auto Optimization Settings” dan klik Start.
Hasilnya adalah:
Kita bisa memodifikasi gambar yang sudah
kita buat dengan menggunakan menu tools settings. Misal untuk memunculkan angka
pada setiap atom,. Caranya hanya check pada label yang ada di Display types
Gambar di bawah adalah tampilan pada “Van
der Waals Spheres”
Sedangkan untuk memunculkan sudut ikatan,
caranya adalah klik pada gambar:
Tidak ada komentar:
Posting Komentar