BKChem

BKChem adalah alternatif gratis untuk ChemDraw yang sering digunakan . Hal ini terutama berguna untuk menggamabarkan mekanisme reaksi di papan diskusi ini dan bagi mereka yang dapat menulis proyek penghargaan yang memerlukan gambar struktur kimia. Jika ChemDraw adalah sebuah program aplikasi untuk menggambar struktur molekul yang hanya gratsis untuk masa percobaan dan kemudian untuk berlangganan harus dibeli (namun saat ini ChemDraw juga tersedia dan gratis pada yang sudah ada pada KIMIUX.

BKChem adalah (seperti dalam perangkat lunak bebas) gratis program gambar kimia. Ia disusun dan ditulis oleh Beda Kosata dan saat ini dikelola oleh Reinis Danne .

BKChem ditulis dengan Python , bahasa pemrograman ditafsirkan dan sangat bagus . BKChem harus dapat digunakan pada semua sistem modern.

 

Meskipun BKChem dikembangkan di GNU / Linux . Namun bisa juga digunakan pada WinXP dan MacOS X.

Di bawah ini adalah link ke website pengembang : http://bkchem.zirael.org 

dan untuk mendownload bisa di  http://bkchem.zirael.org/download.en_html

Inilah tampilan Default BKchem

 

Struktur naftalena adalah dua cincin benzena yang menempel. Untuk menggambar cincin benzena maka klik ikon seperti cincin heksagonal. Klik dua kali pada lembar berwarna putih seperti pada gambar di bawah ini.

Putar cincin naftalena agar berada pada posisi horizontal dengan cara mengeklik ikon Rotate dan dragmenuju posisi horizontal seperti gambar di bawah ini.

Karena reaksi ini merupakan reaksi sulfonasi maka kita harus menambahkan tanda “+” dan teks “SO3″ seperti gambar di bawah ini. Jangan lupa untuk memberikan nama Naftalena tepat di bawah cincin naftalena..

Setelah itu kita tambahkan dua panah equilibrium dengan cara mengeklik ikon panah dan pilih Equilibrium.Klik pada lembar putih sebanyak 2 kali.

Kita harus memutar seperti halnya pada cincin naftalena dengan mengeklik ikon Rotate. Posisikan panah equilibrium seperti gambar di bawah ini.

Copy cincin naftalena dengan cara Grouping seperti gambar di bawah ini dan pilih Paste sebanyak dua kali.

 

Setelah itu tempatkan cincin naftalena sebagai produk dan tambahkan cabang seperti gambar di bawah ini.

Gugus yang menjadi cabang pada cincin naftalena adalah SO3H, maka kita tuliskan teks “SO₃H”.

Lalu beri nama pada kedua produk seperti gambar di bawah ini.

 Semoga bermanfaat dan selamat mencoba :)

Gabedit

Gabedit adalah antarmuka pengguna grafis untuk paket kimia komputasi seperti Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem
Hal ini dapat menampilkan berbagai hasil perhitungan termasuk dukungan untuk sebagian besar format file utama molekul. The “Molekul Builder” canggih memungkinkan untuk cepat sketsa dalam molekul dan memeriksa mereka di 3D. Grafik dapat diekspor ke berbagai format, termasuk animasi.

Fitur-fitur utama :

1.    Gabedit dapat Membuat file input untuk GAMESS (AS), GAUSSIAN, Molcas, MOLPRO, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem.

2.   Gabedit grafis dapat menampilkan berbagai Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess, Q-Chem, (sebagian) ErgoSCF dan (sebagian) ADF hasil perhitungan, termasuk yang berikut

a.      Molecular orbital.

b.      Permukaan dari kerapatan elektron, potensial elektrostatik, NMR kepadatan perisai, dan properti lainnya.

c.       Permukaan dapat ditampilkan dalam mode jala padat, tembus dan kawat. mereka dapat colorcoded oleh properti terpisah.

d.      Kontur (colorcoded), Pesawat colorcoded, Dipole. XYZ sumbu dan sumbu utama molekul.

e.      Animasi dari mode normal sesuai dengan frekuensi getaran.

f.        Animasi rotasi geometri, permukaan, kontur, pesawat colorcoded, xyz dan sumbu utama molekul.

g.      Animasi kontur, Animasi pesawat colorcoded.

3.   Gabedit dapat menampilkan spektrum UV-Vis, IR dan Raman dihitung.

4.   Gabedit dapat menghasilkan file Povray untuk geometri (termasuk ikatan hidrogen), permukaan (termasuk permukaan colorcoded), kontur, pesawat colorcoded.

5.    Gabedit dapat menyimpan gambar di BMP, JPEG, PNG, PPM dan format PS.

6.   Gabedit otomatis dapat menghasilkan serangkaian gambar untuk animasi (getaran, konvergensi geometri, rotasi, kontur, pesawat colorcoded).

7.    Simulated Annealing dengan Dinamika Molekuler diimplementasikan dalam Gabedit (menggunakan Amber 99 parameter molekul mekanik)

Untuk menginstall aplikasi gabedit antara lain:

1.    menggunakan terminal

a.    ketik cd spasi/etc/apt/

b.   lalu tekan tombol enter

c.    jika anda ingin terhubung dengan repo unnes, ganti http: ……….co.id (yg ada pada masing-masing layar anda) dengan http://repo.unnes.ac.id/repo/(dengan cara mengganti= search kemudian replace)

d.   lanjutkan dengan mengetik sudo-apt-get-update

e.    ketik sudo apt insatall Gabedit

f.     lalu tekan tombol enter

2.   mengunakan sypnatic

a.    klik administration

b.    kemudian pilih synaptic packed manager

c.    pilih science( untuk aplikasi tentang science)

d.   ketikkan kata “gabedit” pada kotak search

e.    klik kanan kotak yang masih berwarna putih (mark for installation)  lalu apply